|
[51CTO.com クイック翻訳] LIMS (Laboratory Information Management System) は、医療記録、顧客データ、在庫などを管理するために研究室や病院環境で使用されるソフトウェアです。 一部の病院や診療所では、カスタマイズを可能にしながら必要な機能をデフォルトで提供するカスタム LIMS またはサブスクリプションベースのサービスを作成するために開発者を雇っています。 LIMS を利用する上で、機能のアップグレード、セキュリティ、UI/UX、サポートといった理由から上記の方法が推奨されていますが、有料プランと同等の優れたエクスペリエンスを提供する無料およびオープンソースの代替手段もいくつかあります。以下にそれらをまとめます。 1.セナイト Senaiteは、Plone CMSインフラストラクチャ上にPythonで構築された、信頼性の高いWebベースのLIMS/LISです。現在も活発に開発が進められており、RESTを最大限に活用した優れたJSON APIの実装やモジュール性など、開発者に豊富なカスタマイズオプションを提供しています。 美しくレスポンシブなGUIと、カスタマイズ可能でカラフルなダッシュボードを備えています。SenaiteはLinuxサーバーでも動作し、習得も使用も簡単です。 Senaite - エンタープライズラボ情報管理システム 2. LIMSを開く Open LIMS は 2010 年に登録され、2016 年以降は更新されていませんが、ダウンロード数がますます増加していることから、開発者はいくつかの分野で素晴らしい仕事をしたに違いありません。 PHPとPostgreSQLを使用して開発されており、Linuxサーバーと最新のWebブラウザで動作し、ユーザーフレンドリーなGUIを備えています。また、様々なプロジェクトに合わせてカスタマイズされた無料プラグインを使用して機能を拡張できます。 Open-LIMS - オープンソースのラボ情報管理システム 3. バオバブ LIMS Baobab LIMSは、Webベースでコミュニティ主導型、完全にカスタマイズ可能、そしてユーザーフレンドリーです。アフリカとヨーロッパの研究者によって開発され、生物学的サンプルの管理を目的としています。 Senaiteと同様に、Pythonで記述されており、コードはPlone CMSに基づいています。包括的なドキュメントと、ユーザーが解決策を見つけるのを支援するコミュニティが用意されています。 Baobab LIMS - バイオバンク向けオープンソースLIMS 4. メタLIMS MetaLIMSは、ゲノム処理とメタデータ収集に特化した、セットアップが簡単なWebベースのLIMSです。PHPとMySQLで開発されており、レスポンシブなGUIを備えています。 MetaLIMS では、ユーザーの技術レベルに関わらず、適切なデータ保存のための新しいフィールドを簡単に作成できます。包括的なドキュメントが用意されており、AWS Lightsail などのサービスと連携して使用できます。 MetaLIMS - 小規模メタゲノム研究室向けのオープンソースLIMS 5. ビカ・リムス Bika LIMSは「プロフェッショナルにサポートされた最高のOS LIMS」を自称しており、その信頼性は疑いようがありません。Bika LIMSは最も古く、最も人気のあるオープンソースLIMSの一つであり、Bika Water、Bika Cannabis LIMS、Bika Health、Bika Interlabなど、いくつかの派生製品があります。 Bika Health は、モバイル デバイスやタブレット デバイスで使用できるレスポンシブ UI を備えた Web ベースのプラットフォームで、ラボの在庫、カタログ作成、レポート作成に必要なツールに重点を置いています。 Bika LIMS - オープンソースLIMS 6. C4G基本検査情報システム C4G BLIS は、米国疾病予防管理センター (CDC) の Computing for Good (C4G)、アフリカ諸国の保健省、ジョージア工科大学によって共同で開発されました。 これは主に患者、検査結果、検体の追跡に使用され、システムに関するすべての研究は公式ウェブサイトのリンクから参照できます。 7. ERPNext - ラボ管理モジュール ERPNextは、ユーザーがビジネスを完全にコントロールできるエンタープライズ・リソース・マネジメント(ERP)ソフトウェアであり、複数のモジュールで構成されています。私たちが注目しているのは、ERPNext Labs Managementモジュールです。 ERPNextのラボ管理モジュールは、Python、MySQL、NodeJSを使用して開発されており、レスポンシブなGUIを備えています。また、在庫管理、患者への請求、コンサルテーション、予約管理のための統合モジュールも含まれています。 ERPNext は、無料のオープンソースの包括的なエンタープライズ リソース プランニング ソフトウェアです。 8. eLabFTW eLabFTWは、在庫管理、セキュリティ、柔軟性に重点を置いたWebベースのLIMSです。PHPとMySQLで構築されており、レスポンシブなGUIを備え、モバイルデバイスやタブレットデバイスにも対応しています。 さらに、このホワイト ペーパーで説明した他のソフトウェア システムとは異なり、eLabFTW はユーザーに SAML2 検証、スケジューラ、ファイル マネージャ、分子描画機能を提供します。 eLabFTW - オープンソースの電子実験ノート 9. クローバー Clover は、生物学文書を簡単に作成し、研究室のリソースを管理および検索できるように設計された PHP5 LIMS です。 Clover は生物学研究所 (特に植物研究所) の植物生物学者によって構築され、注文リクエストの管理、レポートの作成、カタログの編集に優れています。 Clover - 生物学研究室向けオープンソースLIMS 10. GNU LIMS/オッキオリーノ GNU LIMS(別名Occhiolino)は最後に紹介しますが、決して重要度が低いわけではありません。これは、最新のスケーラブルで柔軟なLIMSであり、検査システムとの自動インターフェース、リアルタイムでの検査処理が可能で、生物医学科学向けのGNU Healthと完全に統合されています。 会計、在庫管理、デジタル署名処理、レポート作成、請求書発行、監査、ワークフロー管理などの機能を備えています。また、複数の言語をサポートし、機能を拡張するためのプラグインも用意されており、オープンソースコミュニティによってサポートされています。 GNU LIMS - 医療向けオープンソースLIMS これらは私たちが推奨するLIMSソリューションです。紹介するソフトウェアはすべて無料のオープンソースで、包括的なドキュメントと初心者向けのサポートコミュニティが用意されています。 原題: ベスト 10 フリーおよびオープンソースのラボ管理システム、著者: Martins D. Okoi [この記事は51CTOによって翻訳されました。提携サイトへの転載の際は、元の翻訳者と出典を51CTO.comとして明記してください。] |
優れた無料オープンソースのラボ管理システム10選
関連するおすすめ記事
-
-
これまでにオープンソース コードを書いたことがない場合は、履歴書を送らないでください。
-
-
知っておくべき6つのオープンソースAIツール
-
89, 89); margin: 0px; padding: 0px; background: none 0% 0% / auto repeat scroll padding-box border-box rgba(0, 0, 0, 0);">resource ( s )
2022/07/02 13:17:33 1 つのリソースを作成しています
2022/07/02 13:17:33 1 つのリソースを作成しています
2022/07/02 13:17:33 検出キャッシュをクリアしています
2022/07/02 13:17:33 タイムアウト1 分で4つのリソースの待機を開始
2022/07/02 13:17:39 43個のリソースを作成しています( s )
2022/07/02 13:17:39 5分0 秒のタイムアウトで43のリソースの待機を開始
2022/07/02 13:17:40 デプロイメントの準備ができていません: argocd / argocd - applicationset - controller 。 予想される1 個のポッドのうち0 個が準備ができています
2022/07/02 13:17:42 デプロイメントの準備ができていません: argocd / argocd - applicationset - controller 。 予想される1 個のポッドのうち0 個が準備ができています
……
2022/07/02 13:19:44 デプロイメントの準備ができていません: argocd / argocd - applicationset - controller 。 予想される1 個のポッドのうち0 個が準備ができています
2022/07/02 13:38:27 デプロイメントの準備ができていません: argocd / argocd - dex - server 。 1 個のポッドのうち0 個が準備完了です
2022/07/02 13:38:30 リリースインストールに成功しました: argocd / argo - cd - 4.9.11
2022-07-02 13:38:30 ✔ [ 成功] ツール( argocd / default ) の作成が完了しました。
2022 - 07 - 02 13 : 38 : 30 ℹ [ 情報] -------------------------- [ 処理の進行状況: 4/4 。 ] --------------------------
2022 - 07 - 02 13 : 38 : 30 ℹ [ INFO ] 処理中: ( argocdapp / default ) -> 作成...
2022-07-02 13:38:31 ℹ [ INFO ] application . argoproj . io / dtm - test - go が作成されました
2022-07-02 13:38:31 ✔ [ 成功] ツール( argocdapp / default ) の作成が完了しました。
2022-07-02 13:38:31 ℹ [ 情報] -------------------- [ 処理が完了しました。 ] --------------------
2022-07-02 13:38:31 ✔ [ 成功] すべてのプラグインが正常に適用されました。
2022-07-02 13:38:31 ✔ [ 成功] 申請が完了しました。適用プロセス中、実行状態は定義された状態バックエンドストレージに保存されます。例えば、ローカルストレージを使用している場合、実行状態はルートディレクトリのdevstream.stateファイルに保存されます。合計4つのツールチェーンがあり、最初の2つが完了し、最後の2つが認識された場合、最初の2つのプラグインの状態がこのファイルに保存されます。次回の再適用時には、最後の2つのツールチェーンのみを実行する必要があります。
上記で定義したツールチェーンは、最終的に GitHub 上に Golang Web 用のスキャフォールディングされたアプリケーション コード リポジトリを作成します。
GitHub Actions は、CI 操作と Docker イメージの構築に使用されます。
CI プロセスは最終的にイメージを Docker Hub にプッシュします。
その後、ArgoCD が Kubernetes にデプロイされます。
$ kubectl get pods -n argocd
名前準備完了ステータス再起動年齢
argocd - アプリケーション- コントローラー- 0 1 / 1 実行中0 5 分55秒
argocd - アプリケーションセット- コントローラー- 64 d8c477f4 - 2 wrg6 1 / 1 実行中0 5 分55秒
argocd - dex - サーバー- dbdbf5499 - krmfz 1 / 1 実行中0 5 分35秒
argocd - 通知- コントローラー- b67c4bdb4 - 22 t9l 1 / 1 実行中0 5 分55秒
argocd - redis - df9db799b - 8 gbpv 1 / 1 実行中0 5 分55秒
argocd - リポジトリ- サーバー- 56769 cdd47 - zs65j 1 / 1 実行中0 5 分55秒
argocd - サーバー- 7 d4745f689 - w5pp7 1 / 1 実行中0 5 分55秒最後に、ArgoCDを使用してCD操作を実行し、サンプルアプリケーションをKubernetesクラスターにデプロイします。基本的には、ArgoCDアプリケーションオブジェクトを作成します。
$ kubectl アプリケーションを取得- n argocd
名前同期ステータスヘルスステータス
dtm - テスト- go 不明健康ArgoCD を通じて、デプロイされたアプリケーションの詳細を表示することもできます。
最後に、ツールチェーン全体を削除する場合は、`dtm delete` コマンドを実行するだけです。
プロセス全体は非常にスムーズでした(ただし、何らかの理由でGitHubへのアクセスが非常に遅かった点を除けば)。必要なプラグインを設定ファイルで定義するだけで済みます。プラグインの設定方法の詳細については、公式ドキュメント(https://docs.devstream.io/en/latest/plugins/plugins-list/)をご覧ください。
YAML設定ファイルに必要なDevOpsツールを定義するだけで、たった1つのコマンドでDevOpsツールチェーンとSDLCワークフロー全体を構築できます。DevStreamはまさに魔法のツールと言っても過言ではありません。
Git リポジトリ: https://github.com/devstream-io/devstream。
-
EUのオープンソース移行コストに関する秘密調査が漏洩